控制科学与工程学科，在2006年获得一级学科硕士学位授予权。其二级学科“控制理论与控制工程”年同时获批省级重点学科。

本学科依托国家绿色镀膜技术与装备工程技术研究中心、光电技术与智能控制教育部重点实验室（兰州交通大学）、甘肃省高原交通信息工程及控制重点实验室、甘肃省物流及运输装备信息化工程技术研究中心等省部级以上重点实验室和工程技术研究中心以及机电技术研究所等科研机构，在研究生培养和学术研究方面取得了十分显著的成绩，并已形成稳定的具有一定特色的研究方向。主要研究领域涉及控制理论与控制工程、模式识别与智能系统、检测技术与自动化装置等。主要研究方向包括复杂系统建模、控制与优化以人工智能、先进控制理论及应用、模式识别与智能系统、智能机器人技术与应用、检测技术与系统设计、机械（车辆）设备状态监测与故障诊断等。